ゲゲゲ学園為完全中學制，校園設有小學部、中學部與高中部。無論是剛開始接觸人類社會的鬼太郎，或是為了考東大努力的田中ゲタ吉，都可以依自己的需求選擇適合的學院。
另外，我們也為非人類型態、難以融入群體和過於立體（？）的鬼太郎亞種們設立了特殊專班，所有鬼太郎都能在ゲゲゲ学園裡留下快樂的回憶。
最近接到需求，針對各地頻繁發生的水木幼化現象，我們也緊急增設新規則，讓所有幼化水木也能安心上學。